Me he topado con Fuzzwich, una aplicación web que te permite hacer rápidamente, tus propias animaciones en 2d.

Lógicamente es una herramienta bastante limitada, sobretodo en cuento a música de fondo y a la aplicación de escenarios, pero al menos te permite subir imágenes para aplicar como caras de personajes.

Lo mejor es que lo probéis por vosotros mismos, se pueden hacer cosas interesantes, nosotros lo hemos probado.